Les rapports

Des procédures prédéfinies facilitent l'extraction des informations de FishBase. Elles exécutent des recherches globales et impriment des résumés, tels que des synopsis d'espèce et des listes par pays. Dix types de rapports ont été spécifiés (et ne prennent bien sûr en compte que les données entrées jusqu'à présent dans FishBase), en particulier :

des synopsis par espèce ;
des listes de toutes les espèces par famille ;
différents catalogues par pays ;
des listes de noms communs par pays et par culture, ainsi que le savoir traditionnel qui leur est associé ; et
des données sur la dynamique des populations, par famille.

Synopsis d'espèce

Les synopsis d'espèces sont des rapports standardisés fondés sur le format recommandé pour les documents similaires de la FAO par Rosa (1965). Les informations dans ce document sont imprimées directement de FishBase, sans aucune annotation additionnelle. Ils doivent donc être seulement utilisés comme des documents de travail et non comme des publications effectives.

Deux types de synopsis sont disponibles par la fenêtre SPECIES SYNOPSIS : synopsis court (Short) ou complet (Full). Un synopsis court est une présentation standardisée des informations de base sur une espèce donnée comprenant les informations extraites des tables FAMILIES, GENERA, SPECIES, SYNONYMS, COMMON NAMES, STOCKS, COUNTRY, REFERENCES et COLLABORATORS. Un synopsis complet utilise les informations de toutes les tables de FishBase. Pour des espèces très étudiées comme Oreochromis niloticus niloticus, Clupea harengus ou Oncorhynchus mykiss, un synopsis complet peut comprendre plus de 200 pages.

L'exactitude des informations dans ces deux types de documents n'est pas garantie et nous sommes bien conscients qu'ils peuvent être incomplets. Aussi nous vous invitons à communiquer au projet FishBase les corrections et les informations complémentaires, de préférence sous forme de tirés-à-part ou de rapports.

Vous devenez ainsi un collaborateur de FishBase et obtenez une copie de FishBase.

Comment y arriver

Cliquer sur le bouton Reports de la fenêtre MAIN MENU puis sur le bouton Species Synopses dans la fenêtre PREDEFINED REPORTS.

Toutes les espèces d'une famille

Le module Reports by Family comprend trois procédures qui établissent les listes suivantes (et qui ne prennent bien sûr en compte que les données entrées jusqu'à présent dans FishBase) :

le catalogue (Checklist) de toutes les espèces d'une famille ; il inclut un résumé des informations concernant la famille et pour chaque espèce, son nom scientifique valide, l'auteur de sa description originale, son nom commun FishBase, sa répartition géographique, sa taille maximale, sa répartition en profondeur, son habitat, son mode éventuel de migration et la référence principale d'où ont été extraites ces informations ;
le catalogue avec résumés (Checklist with Summaries) qui est une extension de( 1) ; il inclut les caractères morphologiques distinctifs et les caractères méristiques, l'environnement, l'habitat, la biologie, l'importance des utilisations humaines et les références analysées ;
la liste des espèces nominales (List of Nominal Species) qui comprend les combinaisons originales, les nouvelles combinaisons et les synonymes des espèces d'une famille avec leur statut de validité actuel.

Les listes sont fournies avec une bibliographie et l'option (2) donne en plus la liste de tous les collaborateurs qui ont travaillé sur les espèces de la famille en question. Les listes (1) et (3) peuvent être affichées à l'écran et imprimées, la liste (2) imprimée seulement. Les affichages à l'écran contiennent des liens avec d'autres tables, par exemple un double-clic sur le nom scientifique ouvrira la vue SPECIES pour les noms valides ou la vue SYNONYMS pour les synonymes.

Comment y arriver

Cliquer sur le bouton Reports de la fenêtre MAIN MENU puis cliquer sur le bouton All Species of a Family dans la fenêtre PREDEFINED REPORTS.

Les différentes listes de poissons par pays

Le module Checklists by Country comprend des procédures qui établissent les listes suivantes pour tout pays :

tous les poissons (All fishes) signalés dans ce pays ;
tous les poissons marins (Marine) signalés dans ce pays ;
tous les poissons d'eau douce (Freshwater) signalés dans ce pays ;
tous les poissons introduits (Introduced) dans ce pays ;
tous les poissons cibles de la pêche sportive (Game fishes) dans ce pays ;
tous les poissons faisant l'objet d'une aquaculture (Aquaculture) dans ce pays ;
tous les poissons menacés (Threatened) dans ce pays ;
tous les poissons dangereux (Dangerous) pour l'homme signalés dans ce pays ;
tous les poissons d'aquarium (Aquarium) signalés dans ce pays ;
tous les poissons protégés (Protected), totalement ou partiellement dans ce pays ;
toutes les espèces d'une famille (Family) signalées dans ce pays ;
des statistiques (Statistics) sur les poissons du pays, c'est-à-dire, un nombre d'espèces selon diverses catégories ; et
une liste préliminaire des spécimens échantillonnés (Collection) dans ce pays et qui sont entreposés à l'heure actuelle dans différents muséums.

Ces listes incluent quelques informations sur la géographie, le climat, l'hydrologie et les conditions environnementales du pays. Quelques statistiques sont aussi présentées sur le nombre, le type, l'utilisation et les connaissances sur les poissons.

Les espèces sont arrangées par Ordre et par Famille avec des informations sur la taille maximale ; l'habitat ; l'importance dans les pêcheries, l'aquaculture, le commerce aquariophile, la pêche sportive ; l'utilisation comme appât ; le danger potentiel pour l'homme ; les statuts de menace et de protection.

Des indications peuvent aussi être données sur les signalements dans le pays, les usages humains, les spécimens dans les musées, etc.

La liste peut être affichée, imprimée ou redirigée dans un fichier texte. Les affichages à l'écran contiennent des liens avec les autres tables qui sont ainsi accessibles de façon interactive, par exemple en double-cliquant sur l'espèce.

Comment y arriver

Cliquer sur le bouton Reports de la fenêtre MAIN MENU puis sur le bouton Different Checklists by Country dans la fenêtre PREDEFINED REPORTS.

Noms communs

Le module Common Names comprend trois procédures qui établissent les listes suivantes à partir de la table COMMON NAMES et qui peuvent être affichées, imprimées ou redirigées dans un fichier texte :

La procédure Species by Common Name établit la liste des noms communs recherchés à partir d'un terme entré par l'utilisateur, avec le nom scientifique valide de l'espèce, la famille à laquelle elle appartient, et le pays où le nom commun est utilisé (entre parenthèses). Pour des noms communs qui font référence à plusieurs espèces, par exemple ‹ requin ›, ‹ mérou ›, ‹ morue ›, ‹ poisson-chirurgien ›, etc., la liste peut compter plus de 100 noms.
La procédure Common Names by Language établit la liste des noms communs des poissons dans la langue spécifiée par l'utilisateur, avec des précisions sur le pays où les noms sont utilisés et le nom scientifique valide de l'espèce correspondante.
La procédure Local Knowledge établit la liste des noms communs utilisés dans la langue et le pays spécifiés par l'utilisateur, avec le nom scientifique valide de l'espèce correspondante, et éventuellement l'étymologie du nom commun ainsi que des informations sur l'espèce relatives à la culture (définie par la langue et le pays spécifiés).

Chaque liste est suivie de la liste bibliographique de toutes les sources utilisées. Les affichages à l'écran contiennent des liens avec les autres tables qui sont ainsi accessibles de façon interactive, par exemple un double-clic sur le nom scientifique ouvrira la vue SPECIES et sur le nom commun, la vue COMMON NAMES.

Comment y arriver

Cliquer sur le bouton Reports de la fenêtre MAIN MENU puis sur le bouton Common Names dans la fenêtre PREDEFINED REPORTS.

Des données sur la dynamique des populations par famille

Le module Population Dynamics a été incorporé au module Reports pour faciliter l'accès aux données de dynamique des populations par famille dans FishBase. Il comprend quatre procédures dont les résultats peuvent être affichés, imprimés ou redirigés dans un fichier texte, et sont assortis de la liste bibliographique de toutes les sources utilisées pour la constitution des tables. Les affichages à l'écran contiennent des liens avec d'autres tables qui sont ainsi accessibles de façon interactive par un double-clic sur les lignes. Le bouton Start lance la recherche des informations pour la famille spécifiée et les renvoie vers le type de sortie choisi.

La procédure Growth Parameters renvoie une liste des paramètres de croissance issue de la courbe von Bertalanffy (CVB) : le coefficient de croissance (K ; an-1), la longueur asymptotique (L ; cm) et l'âge à la longueur zéro (t0 ; an).

La procédure Maturity Information renvoie une liste de la longueur moyenne et de l'âge à première maturité (tm ; an), le sexe et l'intervalle des longueurs (cm) des spécimens utilisés.

La procédure Natural Mortality renvoie une liste des estimations de mortalité naturelle (M ; an-1), la méthode utilisée pour obtenir la valeur de M‚ la température moyenne de l'environnement (°C) et les paramètres CVB, K et L.

La procédure Length-Weight Relationships renvoie une liste des coefficients de régression (a) et (b), l'intervalle des longueurs (cm) des spécimens utilisés, le nombre de spécimens de l'échantillon et le coefficient de corrélation (r) de la régression logarithmique-linéaire des valeurs de longueur et de poids souvent utilisé dans l'estimation des coefficients a et b.

Comment y arriver

Cliquer sur le bouton Reports de la fenêtre MAIN MENU puis sur le bouton Population Dynamics by Family dans la fenêtre PREDEFINED REPORTS.

Référence

Rosa, H., Jr. 1965. Preparation of synopses on the biology of species of living aquatic organisms. FAO Fish. Synops. No. 1, Rev. 1. 75 p.

Maria Lourdes D. Palomares